iPS細胞と同様の万能細胞に胚性幹細胞（ES細胞）があるが、これはヒトの受精卵を利用するため倫理的に議論され、また拒絶反応が起きるなどの問題が指摘されてきた。患者自身の皮膚細胞から作成されるiPS細胞は、これらを解決し再生医療の発展に大きく貢献するものと注目を集めている。